A medida que los combates durante la Guerra del Pacífico se intensificaron, Tokio fue a menudo objeto de ataques aéreos de las fuerzas aliadas. Para escapar de los bombardeos, los civiles construyeron refugios en toda la ciudad. Aunque muchos no sobrevivieron a la guerra, unos pocos son todavía fácilmente accesibles.
Uno de esos refugios se encuentra en los terrenos del Santuario Senju, que contiene dos santuarios fundados originalmente en 926 y 1279. El improvisado refugio de hormigón podría albergar a una docena de personas si se presenta la ocasión. Aunque hoy en día está abandonado, el refugio antiaéreo sobrevivió a la guerra y el santuario lo conserva como recuerdo de la historia de la guerra.
El santuario en sí mismo, sin embargo, no tuvo tanta suerte. El edificio fue destruido en un ataque aéreo el 3 de abril de 1945 y quedó en ese estado hasta que fue restaurado 13 años después. En los terrenos del santuario, también hay un árbol de ginkgo que sobrevivió al bombardeo, medio quemado, pero aún en pie. También se pueden encontrar otros árboles dañados por la guerra en varios templos cercanos.
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